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3.1.添加SPC后,微環(huán)境發(fā)生了變化
為了研究添加SPC對(duì)微環(huán)境的瞬時(shí)影響,在添加SPC劑量后3小時(shí),測(cè)試環(huán)境變量,包括pH、ORP和溶解物質(zhì)。圖1a顯示硫酸鹽、碳酸鹽、DOC和pH的量隨著SPC劑量的增加而增加,且增量與SPC劑量呈線性相關(guān)。相反,ORP降低,ORP降低與SPC劑量呈線性相關(guān)。
圖1。加入SPC后,環(huán)境變量發(fā)生變化。(a)SPC劑量與環(huán)境變量增減的關(guān)系;(beh)隨著SPC劑量的不同,環(huán)境變量在不同時(shí)期發(fā)生變化(基于鄧肯檢驗(yàn),采用SPSS中的雙向方差分析對(duì)顯著差異進(jìn)行檢驗(yàn);大寫(xiě)字母表示不同時(shí)期一種治療的差異,小寫(xiě)字母表示同一時(shí)期不同治療之間的差異,n?3,a?0.05)。
基于這些結(jié)果,對(duì)于以下結(jié)果,使用對(duì)照(C)、低(L)、中(M)和高(H)微宇宙來(lái)表示空白對(duì)照和三劑量SPC(11.2,22.4,和33.6毫摩爾SPC G-1濕沉積物)。圖1b-h顯示加入SPC后微觀環(huán)境變量的趨勢(shì)不同。首先,pH值在第15天下降,之后保持穩(wěn)定。第二,ORP在第15天下降,之后緩慢上升。第三,碳酸鹽和DOC在第15天增加,但在第37天顯著減少,之后保持穩(wěn)定。此外,在使用SPC處理的所有微觀世界中,磷酸鹽在第15天顯著增加,而在L水平處理中減少,在第37天M和H微觀世界中增加。然而,添加SPC后的硫酸鹽在第15天降至C微觀結(jié)構(gòu)的水平,在第50天降至C微觀結(jié)構(gòu)的值以下;在第15天,L、M和H微觀結(jié)構(gòu)中的銨含量超過(guò)了C微觀結(jié)構(gòu)中的銨含量。
3.2.添加SPC后微生物群落的潛在代謝活性
圖2a顯示了Biolog生態(tài)板的AWCD,用于描述本地微生物群落的潛在代謝活動(dòng)。在第0天和第15天,四種處理的AWCD曲線顯示出相似的模式,L、M和H微觀世界的值超過(guò)了C微觀世界的值。在第37天和第50天,AWCD曲線的模式發(fā)生變化,在M和H微觀世界中呈現(xiàn)“S”形。
圖2。在不同時(shí)期(n?3),對(duì)照和SPC處理中所有六組碳源(b)的AWCD曲線(a)和潛在活性(b)。
此外,ECO板的31個(gè)碳源分為六組(Pan等人,2015),包括兩種胺/酰胺、六種氨基酸、七種碳水化合物、九種羧酸、四種聚合物和三種其他碳源。圖2b顯示了ECO板在84 h時(shí)所有六種類別的平均吸光度。顯然,在羧酸和聚合物基團(tuán)中,SPC處理和C基團(tuán)之間未發(fā)現(xiàn)顯著差異;然而,其他四組在不同時(shí)期存在差異。在碳水化合物組中,M和H微觀結(jié)構(gòu)的平均吸光度顯著增加。此外,雜類組在第0天和第15天在M微觀世界中顯著增加,在第15天在H微觀世界中顯著增加。氨基酸組僅在第37天M微觀世界中顯著增加。相反,在胺/酰胺組中,H微觀世界的平均吸光度在第37天顯著降低,M微觀世界在第50天顯著降低。
3.3.添加SPC后本地微生物群落的分類組成和功能群
根據(jù)ANOSIM、ADONIS和MRPP分析(表S2),在每個(gè)時(shí)期觀察到所有樣本的顯著差異(R>0、R2>0、d>0,均p<0.01)。表1總結(jié)了C和SPC處理的微生物群落的α多樣性。Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)表明C、L和M微觀世界之間沒(méi)有顯著差異,而H微觀世界中的差異顯著。在第15、37和50天,H微觀世界中的潮-1和均勻度顯著降低;然而,在L微觀世界中,這些指數(shù)僅在第15天顯著降低。此外,NMDS結(jié)果顯示H水平處理與其他處理之間存在明顯的距離(圖3A)。
表1不同時(shí)期對(duì)照和SPC處理微生物群落的α多樣性分析。
圖3B、C和D顯示了門(mén)、類和屬級(jí)別的微生物群落的分類組成。在門(mén)級(jí)別(圖3B),微生物群落結(jié)構(gòu)主要由九門(mén)組成。在H微觀世界中,擬桿菌和厚壁菌明顯促進(jìn)并代表優(yōu)勢(shì)門(mén),同時(shí)抑制鈣地霉、氯曲菌、酸性細(xì)菌和變形菌。在M微觀世界中,鈣質(zhì)細(xì)菌和酸性細(xì)菌受到抑制。除了在第15天,L和C微觀世界中的氯屈曲增加和變形菌和鈣地霉減少外,L和C微觀世界顯示出相似的分布。圖3C顯示了相對(duì)豐度超過(guò)1%的類別。結(jié)果表明,在任何時(shí)候接受SPC處理的微觀世界中,鈣中毒都有所減少。在H微觀世界中,嗜酸桿菌、Holophagae、Caldiserica和Deltaproteobacteria急劇減少,而梭狀芽孢桿菌顯著增加。在M微觀世界中,α變形菌在第37天和第50天急劇增加,同時(shí)鈣質(zhì)減少。
圖3。微生物群落結(jié)構(gòu)分析。(A)。基于Bray-Curtis距離的NMDS排序圖;(B)門(mén)的分布(相對(duì)豐度)≥1%);(C)類別分布(相對(duì)豐度)≥1%);(D)屬水平的熱圖和聚類分析(顯示為類/屬水平)(相對(duì)豐度)≥0.1%,對(duì)數(shù)10標(biāo)度);(E)微生物群落功能群的相對(duì)豐度(任何示例的相對(duì)豐度>1.5%)。
在屬水平上,獲得了37個(gè)屬(相對(duì)豐度)≥1.0%)和雙聚類分析的熱圖(hclust)用于描述其差異(圖3D)。聚類結(jié)果表明,M微觀世界中的屬與H微觀世界中的屬更相似,而與L和C微觀世界中的屬更相似。此外,37個(gè)屬可分為三類:HA(高豐度,從B7到B16)、MA(中等豐度,從B17到B37)和LA(低豐度,從B1到B6)。在HA組中,10屬代表了C微觀世界中的優(yōu)勢(shì)類群,其中大部分屬于Deltapoteobacteria類,僅在H微觀世界中減少。其他處理效果不明顯。在馬,屬屬于各種類型的類。在第15、37和50天,WCHB1-69家族中的B17硫曲菌屬和B18屬在M和H微觀世界中均明顯減少,而在第15、37和50天,Coriobacteriae家族中的B19苯桿菌屬、B20溶桿菌屬和B21屬增加。從B26到B30的細(xì)菌在H微觀世界中明顯減少。在第15天、第37天和第50天,H和M微觀世界中的LA屬增加,尤其是B5 Petrimonas和B6 Proteininclasticum。在第37天和第50天,M微觀世界中的B4短枝單胞菌明顯增加。
圖3E顯示了自然微生物群落的前八個(gè)功能組(相對(duì)豐度>1.5%,詳細(xì)數(shù)據(jù)和其他組如表S4所示)對(duì)時(shí)間和SPC劑量的響應(yīng)。在H微觀世界中,能夠進(jìn)行化學(xué)異養(yǎng)、發(fā)酵、需氧化學(xué)異養(yǎng)、尿素分解和殼聚糖分解的微生物在整個(gè)取樣時(shí)間內(nèi)增加。能夠進(jìn)行硫酸鹽呼吸和硫化合物呼吸的微生物在第0天增加,之后開(kāi)始減少。能夠暗氧化含硫化合物的微生物在第0天減少,在第15、37和50天增加。除了能夠呼吸硫化物的微生物外,在M微觀世界中,硫酸鹽呼吸和硫化物的暗氧化在第50天減少。其他六組隨時(shí)間增加。在L微觀世界中,八組的順序保持不變,盡管它們?cè)诘?0天減少。
3.4.添加SPC后微生物群落的環(huán)境變量、所考慮的屬和功能組之間的關(guān)系
圖4A顯示了八個(gè)功能群與37個(gè)屬之間的顯著spearman相關(guān)性(p<0.05)。一方面,能夠發(fā)酵和化學(xué)異養(yǎng)的微生物與Petrimonas屬、嗜蛋白菌屬、苛孢霉屬、破蛋白菌屬和未培養(yǎng)的細(xì)菌呈梭狀芽孢桿菌的順序呈強(qiáng)正相關(guān)(系數(shù)>0.6)。能夠解脲的微生物與蛋白碎屑菌和梭菌的順序呈強(qiáng)正相關(guān)。此外,能夠進(jìn)行幾丁質(zhì)分解的微生物與苯桿菌、溶桿菌和短桿菌密切正相關(guān)。此外,能夠進(jìn)行硫酸鹽呼吸和硫化合物呼吸的微生物與聯(lián)營(yíng)養(yǎng)菌、聯(lián)營(yíng)養(yǎng)菌、聯(lián)營(yíng)養(yǎng)菌和聯(lián)營(yíng)養(yǎng)菌科細(xì)菌密切正相關(guān)。另一方面,能夠發(fā)酵和化學(xué)異養(yǎng)的微生物與Smithella、Caldisericum以及不同類別(B28和B30)和不同家族(B29、B32和B18)的細(xì)菌具有強(qiáng)烈的負(fù)相關(guān)。能夠解脲的微生物與史密氏菌和OPB35類細(xì)菌呈強(qiáng)烈的負(fù)相關(guān)。
圖4。添加SPC后,環(huán)境變量、所考慮的屬和官能團(tuán)之間的相關(guān)性分析。(A)功能群與所考慮屬之間的Spearman相關(guān)分析;(B)顯示了環(huán)境變量和考慮的功能組之間的spearman相關(guān)分析(顯著相關(guān)(p<0.05),藍(lán)色和紅色圓圈分別表示正相關(guān)和負(fù)相關(guān),行和列用hclust聚集;*表示系數(shù)大于0.6或小于0.6);(C)基于環(huán)境變量和37個(gè)屬的RDA分析。(有關(guān)此圖例中顏色參考的解釋,請(qǐng)讀者參考本文的Web版本。)
圖4B顯示了環(huán)境變量和功能組之間的顯著spearman相關(guān)性;表明大多數(shù)環(huán)境變量與功能組呈正相關(guān)。簡(jiǎn)單地說(shuō),硫酸鹽主要與硫酸鹽呼吸和硫化物呼吸密切正相關(guān)。DOC、碳酸鹽和磷酸鹽與發(fā)酵、化學(xué)異養(yǎng)、尿素分解和需氧化學(xué)異養(yǎng)密切正相關(guān)。
RDA圖顯示,37個(gè)屬和環(huán)境變量可分為四個(gè)部分,由矩形軸分隔(圖4C)。在第一象限中,磷酸鹽、DOC和碳酸鹽主要與B9、B6和B3有關(guān)。在第二象限,硫酸鹽主要與B14和B26屬有關(guān)。在第三象限中,B17、B18、B16和B7主要與ORP相關(guān),與pH呈負(fù)相關(guān)。在第四象限中,銨主要與B2、B19和B4屬相關(guān)。AVS主要與B20相關(guān)。
一般來(lái)說(shuō),各種化合物,如氨、硝酸鹽、硫酸鹽、有機(jī)污染物和金屬離子,共存于受污染的沉積物中。其中一些可以用作天然微生物的電子受體或供體。在本研究中,環(huán)境條件與SPC劑量之間的線性關(guān)系(圖1a和表S1)表明,SPC添加量越高,導(dǎo)致溶解物質(zhì)增加,并降低受污染沉積物中的ORP。此外,水生生態(tài)系統(tǒng)中的溶解有機(jī)物含有氧化還原活性部分;ORP的下降表明溶解有機(jī)物的這些氧化還原部分被氧化,因?yàn)檠趸糠志哂羞€原電位Eh(Lau等人,2017)。這可能是部分氧化效應(yīng)(De la Calle et al.,2012)和SPC的洗滌效應(yīng)共同作用的結(jié)果。SPC通常被用作H2O2的來(lái)源,H2O2是一種強(qiáng)氧化劑,也是洗滌劑的主要成分(Zonfrilli et al.,2009)。此外,環(huán)境條件的后續(xù)變化,包括硫酸鹽還原率升高(圖1b-h)、AVS回收量(圖S1)、溶解有機(jī)物還原(圖S2)、有機(jī)酸生產(chǎn)(表S3)和ORP升高,這表明產(chǎn)生的氧化有機(jī)物和硫酸鹽被本地微生物群落利用。此外,AWCD結(jié)果(圖2)表明,微生物群落的不同代謝活性已增強(qiáng)。此外,在不同時(shí)期,代謝活動(dòng)增強(qiáng)(雜項(xiàng)和碳水化合物,圖2B)和功能微生物份額增加(硫酸鹽呼吸和發(fā)酵,圖3E),表明激活的微生物呼吸僅在實(shí)驗(yàn)開(kāi)始時(shí)保持,并且在整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中發(fā)酵得到增強(qiáng)。總之,這些結(jié)果表明,添加SPC可間接提供電子受體或供體,以改善污染沉積物中微生物的代謝活性。這是一個(gè)有利于降低生態(tài)工程成本的策略,特別是對(duì)于原位生物修復(fù)。
近年來(lái),由于非培養(yǎng)方法的快速發(fā)展,微生物群落結(jié)構(gòu)的研究受到了前所未有的重視。微生物群落在分類組成上表現(xiàn)出強(qiáng)烈的差異,而其代謝功能和性能可能保持不變(Louca和Doebeli,2017)。因此,徹底調(diào)查微生物群落對(duì)添加SPC的反應(yīng)需要對(duì)分類組成和功能分析進(jìn)行共同解釋。獲得的阿爾法多樣性結(jié)果(表1)表明,在SPC的H劑量下,微生物群落的異質(zhì)性可能會(huì)下降。獲得的分類學(xué)水平結(jié)果表明,在SPC的H劑量下顯著增加的微生物主要屬于厚壁菌門(mén)(其中許多產(chǎn)生內(nèi)孢子(Onyenwake et al.,2004)),專性厭氧類梭狀芽孢桿菌(川崎等,1998年)、發(fā)酵類Petrimonas屬(Grabowski等,2005年)和蛋白水解類Proteinicreticum屬(Zhang等,2010年)。此外,在M劑量SPC下增加的微生物主要屬于α蛋白細(xì)菌類(在有機(jī)富集沉積物中對(duì)有機(jī)物的分解和同化具有重要作用的細(xì)菌(Kunihiro等人,2011))和異養(yǎng)菌屬Brevundimonas(Tsubouchi等人,2014)。相比之下,嗜酸性細(xì)菌門(mén)、Caldisericia類(硫代硫酸鹽還原菌(Mori et al.,2009))、Holophagae(其成員能夠厭氧降解芳香化合物(Anderson et al.,2012))、硫氧化菌屬Sulfuricurvum(Haaijer et al.,2008;Kodama和Watanabe,2004),鞘氨醇桿菌科的一個(gè)屬(Schmidt et al.,2012)是SPC M和H劑量下最脆弱的微生物。受影響的微生物群落在更高的分類水平(如類群或門(mén)水平)表現(xiàn)出與屬水平相似的重疊和分類豐度,這表明SPC的加入可能會(huì)影響特定狹窄分支內(nèi)的特定屬。此外,在整個(gè)實(shí)驗(yàn)期間,所有這些效應(yīng)很難自發(fā)恢復(fù)到原始狀態(tài)。關(guān)于功能性基團(tuán),獲得的結(jié)果(圖3E和表S4)表明,在所有試驗(yàn)期間,在M和H劑量的SPC下,最豐富的基團(tuán)沒(méi)有改變,對(duì)發(fā)酵、化學(xué)異養(yǎng)、尿解和需氧化學(xué)異養(yǎng)的影響都是積極的。然而,在試驗(yàn)后期,H劑量對(duì)硫酸鹽呼吸和硫化物呼吸的影響為負(fù)。這些發(fā)現(xiàn)表明,微生物群落的分類組成和功能組對(duì)添加SPC的反應(yīng)均表現(xiàn)出劑量依賴性偏差。這表明在生態(tài)工程中應(yīng)考慮SPC的劑量。
先前的研究報(bào)告了地球化學(xué)成分變化與群落結(jié)構(gòu)變化之間的顯著相關(guān)性(Jorgensen等人,2012年;Louca等人,2017年)。在本研究中,改變的環(huán)境變量、顯著增加的微生物組和功能性微生物的優(yōu)勢(shì)之間的強(qiáng)相關(guān)性(圖4)表明,添加SPC后,DOC、碳酸鹽和磷酸鹽是主要變量,富集了特定的微生物,脆弱的微生物組群歸因于ORP。然而,除了顯著增加的微生物與上述功能微生物之間的相關(guān)性外,之前的研究報(bào)告稱,Petrimonas是產(chǎn)氫細(xì)菌(Sun等人,2015),脫氮系統(tǒng)中的蛋白碎屑菌通常非常豐富(Wang等人,2015;Yang等人,2015),柴油中發(fā)現(xiàn)了Brevundimonas(Wang等人,2016)。此外,雜項(xiàng)組的代謝活動(dòng)增強(qiáng)(圖2b)。很可能,增加的屬可能具有不同的代謝能力,并可能參與沉積物修復(fù)中污染物的后續(xù)生物修復(fù)。
環(huán)境變量和微生物群落對(duì)污染沉積物中添加過(guò)碳酸鈉的響應(yīng)——摘要、介紹
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